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國(guó)內(nèi)科學(xué)家實(shí)現(xiàn)50個(gè)水稻基因組重測(cè)序任務(wù)

責(zé)任編輯:新華網(wǎng) 來源:新華網(wǎng) 日期:2011-12-20

    由中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所、深圳華大基因研究院、中國(guó)科學(xué)院研究生院和中國(guó)科學(xué)院植物研究所等單位主導(dǎo)完成的50個(gè)水稻基因組重測(cè)序及遺傳變異數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建等研究成果,本月初在國(guó)際著名雜志《自然-生物技術(shù)》上在線發(fā)表。該研究首次對(duì)栽培稻和野生稻基因組進(jìn)行了大規(guī)模的遺傳變異分析,為科學(xué)家深入挖掘水稻重要農(nóng)藝性狀基因及促進(jìn)水稻分子育種改良等研究提供了寶貴的基因資源。

  據(jù)深圳華大基因研究院有關(guān)方面介紹,亞洲栽培稻是世界上最古老的農(nóng)作物物種之一,具有秈稻和粳稻兩個(gè)主要亞種。在本研究中,科研人員希望能從基因組水平上解析不同栽培和野生稻基因組序列的遺傳變異情況,以利于培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)和抗逆的水稻新品種,提高育種技術(shù)和水平。

  文章的第一作者、華大基因該項(xiàng)目負(fù)責(zé)人劉心說:“研究證明秈稻和粳稻的起源的確是獨(dú)立的,而且粳稻起源于中國(guó)普通野生稻。接下來我們還將進(jìn)行進(jìn)一步的研究,希望能為水稻育種改良等研究提供指導(dǎo)作用?!?/FONT>

  據(jù)介紹,研究人員選取了具有代表性的40個(gè)栽培稻品系和10個(gè)不同地理來源的野生稻進(jìn)行了全基因組重測(cè)序研究,共發(fā)現(xiàn)650萬(wàn)個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn);808000個(gè)小片段的插入/缺失,其中大部分為稀有突變;94700個(gè)長(zhǎng)片段的結(jié)構(gòu)變異和1.676個(gè)拷貝數(shù)變異。

  基于這些遺傳變異數(shù)據(jù),研究人員還發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個(gè)與人工選擇相關(guān)的候選基因,其中有些基因與水稻的農(nóng)藝性狀具有重要的相關(guān)性,而大部分基因的功能尚不清楚。但是據(jù)科研人員推測(cè),這些未知功能的基因也可能與水稻的相關(guān)農(nóng)藝性狀具有重要關(guān)聯(lián)。
 

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