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中國科學(xué)家繪出首張“甜橙基因組圖譜”

責(zé)任編輯:本站編輯 來源:農(nóng)藥工業(yè)網(wǎng) 日期:2012-12-13

    11月26日,在國家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助下,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)鄧秀新院士領(lǐng)銜的柑橘團(tuán)隊(duì)在國際著名學(xué)術(shù)刊物《Nature Genetics》在線發(fā)表了題為“甜橙基因組圖譜”(The draft genome of sweet orange)的研究論文。甜橙基因組的完成將在理論上為柑橘基因功能研究提供框架,也將在應(yīng)用上為果實(shí)品質(zhì)包括色、香、味等重要性狀基因的遺傳選育發(fā)掘及品種改良提供重要平臺(tái)。這也是世界上第一例蕓香科植物基因組圖譜,對(duì)柑橘基因及重要農(nóng)藝性狀的解析具有里程碑的作用。
 
    我國是世界上重要的柑橘原生中心,我國栽培柑橘的歷史悠久,4000年前已有經(jīng)濟(jì)栽培。甜橙品種"伏令夏橙"即可鮮食,同時(shí)也是全球最大的加工橙汁品種。華中農(nóng)業(yè)大學(xué)的甜橙基因組研究團(tuán)隊(duì)對(duì)這一甜橙品種采用最先進(jìn)的全基因組鳥槍測(cè)序法(WGS)及遠(yuǎn)程配對(duì)末端標(biāo)記策略, 拼接組裝所獲得的基因組序列覆蓋率近90%,獲得注釋的基因約3萬個(gè)。通過結(jié)合遺傳標(biāo)記和染色體原位雜交分析,甜橙基因組序列被進(jìn)一步整合到已知的9條染色體, 因此完成了對(duì)甜橙基因組接近完全的解碼和基因定位。
 
    通過對(duì)基因組數(shù)據(jù)的分析,該團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)甜橙基因組中約有一半的基因處于雜合狀態(tài),并有顯著的橘和柚的遺傳特征,其中橘的遺傳成分約占3/4,柚的遺傳成分占1/4,據(jù)此提出了甜橙起源的新理論,即甜橙來源于柚做為母本和橘雜交,其后代再與橘雜交而形成的雜種。通過基因表達(dá)以及基因組比較分析,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)可能在甜橙果實(shí)內(nèi)大量合成維生素C的關(guān)鍵基因。該基因家族的擴(kuò)增、快速進(jìn)化、功能分化以及組織特異表達(dá)等可能與甜橙果實(shí)大量合成維生素C有關(guān)。

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